PubChemからChemSketchに構造式を取り込む

おそらく、PubChemに登録されているものであれば、一から化学構造式を描画する手間を省こうとすると思います。

例えば、前回のように「インドメタシンを書きたい」と思ったら、どっかから構造式データをダウンロードしてきて、読み込ませるでしょう。

なので、PubChemで検索して、構造式データをダウンロードし、ChemSketchに取り込むまでの手順を確認します。

まずはPubChemのIndomethacinのページを開きます。
下にスクロールしていくと「Structures」というセクションがあります。この右上の「Download Coordinates」を選択します。
今回はSDF形式を使います。「Save」をクリックすると、ダウンロードされます。
ChemSketchで「File」＞「Open…」で、ダウンロードしたファイルを開きます。
確認画面が出るので「Yes」。
なんかすごいことになってしまった。。。
PubChemのページで、「DOWNLOAD COORDINATES」の「Display」をクリックすると確かに画面にあるような情報が入っています。余計な分は手で消すしかなさそうです。
ならば、ということで今度は「InChI」をダウンロードして、ChemSketch側で描かせることにしました。
ChemSketchで「Tools」＞「Generate」＞「Structure from InChI」を選びます。
PubChemからコピーしたテキストを貼り付けます。
「OK」とすると、見事に取り込まれました。多分こっちのやり方のほうが早いかな。

ではでは。