ChemSketchでLogPを計算する
ChemSketchにはデフォルトでLogPを計算するアドオンが付いています。
今回はテンプレートからアミノ酸を一つ選んで、LogPを計算させてみます。
- 「Templates」から「Template Window」を選択します。
- 左のメニューで「Amino Acids」を選びます。
- 今回はグルタミン(下記)を選択します。
- 描画画面に貼り付けます。この構造式が選択された状態(周囲に8つの点が付いた状態)にしておきます。
- 「Add-Ons」から「Calculate LogP」を選択します。
- 次の画面が表示され、「Calculated LogP: -1.67+/-0.47」と、結果が表示されます。
- これだけです。
「Add-Ons」メニューから選択したことからもわかるように、LogP計算は追加機能です。もし、「Calculate LogP」がメニューになかったら、何らかの理由でこのアドオンをオフにしている可能性があります。
オンにするには「Options」から「Add-On Organizer」を選択します。
リストから「ACD/LogP Calculator Add-On」にチェックを入れ、「OK」をクリックします。
この画面で「Add-Ons」メニューの内容をコントロールできることはちょっと頭の片隅に入れておくといいかも。
もし、どこかからアドオンを入手したときに、この画面で「Add…」を選べばそれをメニューに追加できます。