ChemSketchでLogPを計算する

ChemSketchでLogPを計算する

ChemSketchにはデフォルトでLogPを計算するアドオンが付いています。

今回はテンプレートからアミノ酸を一つ選んで、LogPを計算させてみます。

1. 「Templates」から「Template Window」を選択します。

   

   Templateメニュー

2. 左のメニューで「Amino Acids」を選びます。

   

3. 今回はグルタミン（下記）を選択します。

   

4. 描画画面に貼り付けます。この構造式が選択された状態（周囲に8つの点が付いた状態）にしておきます。

   

5. 「Add-Ons」から「Calculate LogP」を選択します。

   

   Calculate LogPを選択

6. 次の画面が表示され、「Calculated LogP: -1.67+/-0.47」と、結果が表示されます。

   

   LogPの計算結果

7. これだけです。

「Add-Ons」メニューから選択したことからもわかるように、LogP計算は追加機能です。もし、「Calculate LogP」がメニューになかったら、何らかの理由でこのアドオンをオフにしている可能性があります。

オンにするには「Options」から「Add-On Organizer」を選択します。

Optionsメニュー

リストから「ACD/LogP Calculator Add-On」にチェックを入れ、「OK」をクリックします。

Add-on Organizer

この画面で「Add-Ons」メニューの内容をコントロールできることはちょっと頭の片隅に入れておくといいかも。

もし、どこかからアドオンを入手したときに、この画面で「Add…」を選べばそれをメニューに追加できます。