技術屋にゃん兵衛のてくてくらぼ by データウィズ [DataWith]

気の向くままソフトについて書いてます。バリバリエンジニアではないのであくまでも初心者目線で。

ChemSketchでLogPを計算する

ChemSketchでLogPを計算する

 

ChemSketchにはデフォルトでLogPを計算するアドオンが付いています。

今回はテンプレートからアミノ酸を一つ選んで、LogPを計算させてみます。

 

  1. 「Templates」から「Template Window」を選択します。

    Templateメニュー
  2. 左のメニューで「Amino Acids」を選びます。

  3. 今回はグルタミン(下記)を選択します。

  4. 描画画面に貼り付けます。この構造式が選択された状態(周囲に8つの点が付いた状態)にしておきます。

  5. 「Add-Ons」から「Calculate LogP」を選択します。

    Calculate LogPを選択
  6. 次の画面が表示され、「Calculated LogP: -1.67+/-0.47」と、結果が表示されます。

    LogPの計算結果
  7. これだけです。

 

「Add-Ons」メニューから選択したことからもわかるように、LogP計算は追加機能です。もし、「Calculate LogP」がメニューになかったら、何らかの理由でこのアドオンをオフにしている可能性があります。

 

オンにするには「Options」から「Add-On Organizer」を選択します。

Optionsメニュー

リストから「ACD/LogP Calculator Add-On」にチェックを入れ、「OK」をクリックします。

Add-on Organizer

この画面で「Add-Ons」メニューの内容をコントロールできることはちょっと頭の片隅に入れておくといいかも。

もし、どこかからアドオンを入手したときに、この画面で「Add…」を選べばそれをメニューに追加できます。